Основное направление деятельности центра - взаимодействие с соотечественниками, укрепление позиций русского языка, популяризация русской культуры в Молдавии, работа с неправительственными организациями и молодёжными движениями страны. Работа РЦНК сосредоточена также на развитии культурных, образовательных, научно-технических и информационных связей Российской Федерации с Республикой Молдова, оказании консультационной помощи соотечественникам и соблюдении их гражданских, политических, экономических, социальных, культурных и других прав и законных интересов в стране проживания, сохранении и развитии взаимоотношений с исторической родиной.